甲鱼的功效很多，据《本草纲目》记载：鳖肉可治久痢、虚劳、脚气等病;鳖甲主治骨蒸劳热、阴虚风动、肝脾肿大、肝硬化等病症;鳖血外敷可治颜面神经麻痹、小儿疳积潮热，兑酒可治妇女血痨;鳖卵能治久泻久痢;鳖胆汁有治痔瘘等功效;鳖头干制入药称“鳖首”，可治脱肛、漏疮等。
腹满厌食、大便溏泻、脾胃虚寒者不宜吃甲鱼;有水肿、胸腔或腹腔积液、高脂蛋白症也不应多吃甲鱼;儿童及孕妇当慎。
美容养颜药膳：青蒿甲鱼汤
青蒿10克、干桃花10克(鲜花更好)、黄芪10克、甲鱼200克(去毛，去内脏，保留骨)，将前3味药放入沙锅内，加水适量，煎汤，去渣留液，再与甲鱼一同放入沙锅内煎煮，如药液过少，再加适量清水，约煎半小时后，温度略低时加入蜂蜜即可，连服半月以上。好处：此方有滋阴养颜、补血滋润之功效，适宜女性。
滋阴益气药膳：枸杞沙苑甲鱼汤
甲鱼1只约500克，去头及内脏，切块，枸杞子、沙苑子各50克，洗净用纱布包好，共煮至甲鱼肉烂，去中药加调料，吃肉喝汤。好处：用于气阴两虚、肝肾不足，表现为气短乏力、腰膝酸软、手足心热、白细胞下降等。
补血养阴药膳：当归党参甲鱼汤
甲鱼1只约500克，去头及内脏，切块。用纱布包当归50克、党参50克，与甲鱼共煮至肉烂，去中药加盐及调料即可。好处：用于慢性病贫血、免疫功能低下、口干咽燥、消瘦乏力等症。
养阴止汗药膳：黄芪甲鱼汤
浮小麦100克、生黄芪50克，泡6小时后用纱布包严，甲鱼1只去头及内脏切块后，与中药共煮至肉烂，去中药加盐及味精，吃肉喝汤。调料中不用花椒、辣椒、大料、桂皮等辛温发散之品。好处：用于阴虚内热、盗汗、五心烦热。