避孕药一般指口服避孕药，它的避孕原理主要是通过抑制排卵，并改变子宫颈黏液，使精子不易穿透，或使子宫腺体减少肝糖的制造，让囊胚不易存活，或是改变子宫和输卵管的活动方式，阻碍受精卵的运送。使精卵无法结合形成受精卵，从而达到避孕目的的一种药物。
对卵巢的危害：
由于紧急避孕药的药剂量是常规避孕药的十多倍，就是采用大剂量的药物来干扰卵巢的功能，控制排卵，产生一个比较好的避孕效果。因此，对女性的卵巢功能、肝肾的代谢等系统产生危害，这种危害有时甚至很难估量。即使选用，一年最好不要超过二次。
对生育的危害：
避孕药只能偶尔服用一次，虽然现在还没有具体数据和相关研究直接表明紧急避孕失败而妊娠者，新生儿畸形发生率会升高，但可以肯定的是，它会导致女性月经紊乱，这实际上已经间接地影响了以后的正常怀孕。
对月经的危害：
几乎所有的紧急避孕药都是通过对排卵和子宫内膜抑制而起作用的，并且用药剂量高，因此，在同一月经周期内连续、多次服用紧急避孕药，会增加月经紊乱的发生几率，也会增加失败率。
而短效口服避孕药通常可以使你的月经变得很规律，经量减少，并且痛经减轻。但错误的服用方式同样会导致月经紊乱，从而出现异常增多的月经。比如未按照处方资料进行服用、漏服或错服等，导致机体内的生殖激素水平紊乱，子宫内膜的发育受到影响而发生异常出血。