工程款税率的计算如下：工程结算款1%的个人所得税；工程结算款0.3‰的印花税；工程结算款3%的营业税；营业税1%、5%或7%的城建税；营业税3%的教育费附加。
【法律依据】
《个人所得税法》第三条
个人所得税的税率：
（一）综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率（税率表附后）；
（二）经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率（税率表附后）；
（三）利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。
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