工伤赔偿纠纷能申请仲裁。工伤赔偿案件的前提是在发生工伤事故后要向劳动部门申请工伤认定，认定为工伤后，如果伤情严重，再做劳动能力鉴定，最后才是向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
法律依据：《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条：中华人民共和国境内的用人单位与劳动者发生的下列劳动争议，适用本法：
(一)因确认劳动关系发生的争议;
(二)因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议;
(三)因除名、辞退和辞职、离职发生的争议;
(四)因工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护发生的争议;
(五)因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议;
(六)法律、法规规定的其他劳动争议。
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