知道一条蛋白质的氨基酸序列,该如何了解它的三维结构是否已知呢?
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发布时间：2022-04-24 01:38
共2个回答
热心网友
时间：2023-10-19 03:21
查一下，看看这是神马蛋白，再查是否有人已经发表过这种蛋白的三维结构。
可以用NCBI查一下（我记得可以用那个Blast功能，比对蛋白），再在PubMed里面查一下有关该蛋白的消息，看看有没有关于三维结构的文章发表~
热心网友
时间：2023-10-19 03:22
1. 先用blast (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi) 里面的protein blast （http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastp&BLAST_PROGRAMS=blastp&PAGE_TYPE=BlastSearch&SHOW_DEFAULTS=on&LINK_LOC=blasthome）功能查询。在“Enter accession number(s), gi(s), or FASTA sequence(s) ”输入你要查询的氨基酸序列，然后点击左下角的“blast”，搜索结果是好多个蛋白质的氨基酸序列，每个序列会列出：该序列与你查询的序列有百分之多少相同，相同的是哪一部分。你随便点击任何一个序列，新出现的界面上面有该序列的信息。其中有一项是PUBMED, 后面是阿拉伯数字编码。你点开这个编码，直接就到了PUBMED的界面，会有次序列出处的文献标题、abstract等。
2. 到PDB (Protein Data Bank) http://www.pdb.org/pdb/home/home.do查询，选择PUBMED Abstract.把该文献的Title输入进去，就可以查到是否有结构式。
最好的方法还是，读一下你所查到的文献，找到该蛋白质的名字，直接到PBD上搜索该蛋白质的名称。这样查询，既快速又准确。
热心网友
时间：2023-10-19 03:21
查一下，看看这是神马蛋白，再查是否有人已经发表过这种蛋白的三维结构。
可以用NCBI查一下（我记得可以用那个Blast功能，比对蛋白），再在PubMed里面查一下有关该蛋白的消息，看看有没有关于三维结构的文章发表~
热心网友
时间：2023-10-19 03:22
1. 先用blast (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi) 里面的protein blast （http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastp&BLAST_PROGRAMS=blastp&PAGE_TYPE=BlastSearch&SHOW_DEFAULTS=on&LINK_LOC=blasthome）功能查询。在“Enter accession number(s), gi(s), or FASTA sequence(s) ”输入你要查询的氨基酸序列，然后点击左下角的“blast”，搜索结果是好多个蛋白质的氨基酸序列，每个序列会列出：该序列与你查询的序列有百分之多少相同，相同的是哪一部分。你随便点击任何一个序列，新出现的界面上面有该序列的信息。其中有一项是PUBMED, 后面是阿拉伯数字编码。你点开这个编码，直接就到了PUBMED的界面，会有次序列出处的文献标题、abstract等。
2. 到PDB (Protein Data Bank) http://www.pdb.org/pdb/home/home.do查询，选择PUBMED Abstract.把该文献的Title输入进去，就可以查到是否有结构式。
最好的方法还是，读一下你所查到的文献，找到该蛋白质的名字，直接到PBD上搜索该蛋白质的名称。这样查询，既快速又准确。
