祁门红茶制作工艺精细，采摘一芽二、三叶的芽叶作原料，经过萎凋、揉捻、发酵，再进行文火烘焙至干。
红毛茶制成后，还须进行复杂的精制，经毛筛、抖筛、分筛、紧门、撩筛、切断、风选、拣剔、补火、清风、拼和、装箱十余道工序后，方可制成成茶。
祁门红茶的采摘标准十分严格，现采现制，高档茶以一芽一叶、一芽二叶原料为主，分批多次留叶采，春茶采摘6-7批，夏茶采6批，秋茶少采或不采，其中以8月一批采摘品质最佳。
初制工艺包括萎凋、揉捻、发酵、烘干等工序，其中发酵是决定祁红茶品质的关键，发酵室温控制在30度以下，经过发酵叶色转红，形成祁红茶红叶红汤的品质特点。初制成品称为红毛茶。
红毛茶制成后，还须分清长短、粗细、轻重，剔除杂质。祁红精制很费工夫，所以精制后的祁红茶又称为“工夫茶”。
精制加工后的祁红茶，外形条索紧结细小如眉，苗秀显毫，色泽乌润，香气清香持久，茶市上把这种似果香又似兰花香的香气专门叫做“祁门香”。